Protein–RNA interactions for Protein: Q61817

Creb3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3Q61817 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Creb3Q61817 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Creb3Q61817 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Creb3Q61817 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Creb3Q61817 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Creb3Q61817 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Creb3Q61817 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Creb3Q61817 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Creb3Q61817 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Creb3Q61817 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Creb3Q61817 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Creb3Q61817 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Creb3Q61817 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Creb3Q61817 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Creb3Q61817 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Creb3Q61817 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Creb3Q61817 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Creb3Q61817 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Creb3Q61817 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Creb3Q61817 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Creb3Q61817 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Creb3Q61817 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Creb3Q61817 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Creb3Q61817 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Creb3Q61817 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Creb3Q61817 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Creb3Q61817 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Creb3Q61817 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Creb3Q61817 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Creb3Q61817 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Creb3Q61817 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Creb3Q61817 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Creb3Q61817 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Creb3Q61817 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Creb3Q61817 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Creb3Q61817 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Creb3Q61817 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Creb3Q61817 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Creb3Q61817 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Creb3Q61817 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Creb3Q61817 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Creb3Q61817 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Creb3Q61817 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Creb3Q61817 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Creb3Q61817 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Creb3Q61817 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Creb3Q61817 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Creb3Q61817 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms