Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn1Q61809 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrn1Q61809 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn1Q61809 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn1Q61809 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn1Q61809 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn1Q61809 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn1Q61809 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn1Q61809 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn1Q61809 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn1Q61809 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms