Protein–RNA interactions for Protein: Q61762

Kcna5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna5Q61762 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna5Q61762 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna5Q61762 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna5Q61762 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna5Q61762 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna5Q61762 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna5Q61762 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcna5Q61762 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna5Q61762 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna5Q61762 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcna5Q61762 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcna5Q61762 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcna5Q61762 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcna5Q61762 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms