Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtrxQ61687 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AtrxQ61687 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AtrxQ61687 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AtrxQ61687 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtrxQ61687 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AtrxQ61687 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AtrxQ61687 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AtrxQ61687 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AtrxQ61687 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AtrxQ61687 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AtrxQ61687 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtrxQ61687 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtrxQ61687 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AtrxQ61687 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtrxQ61687 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtrxQ61687 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AtrxQ61687 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtrxQ61687 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtrxQ61687 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AtrxQ61687 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AtrxQ61687 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtrxQ61687 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtrxQ61687 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtrxQ61687 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtrxQ61687 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtrxQ61687 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtrxQ61687 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtrxQ61687 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AtrxQ61687 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AtrxQ61687 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms