Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EsrrbQ61539 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EsrrbQ61539 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EsrrbQ61539 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EsrrbQ61539 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EsrrbQ61539 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EsrrbQ61539 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EsrrbQ61539 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EsrrbQ61539 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EsrrbQ61539 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EsrrbQ61539 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EsrrbQ61539 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EsrrbQ61539 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms