Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E2f1Q61501 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
E2f1Q61501 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E2f1Q61501 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2f1Q61501 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2f1Q61501 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2f1Q61501 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2f1Q61501 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2f1Q61501 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2f1Q61501 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2f1Q61501 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2f1Q61501 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2f1Q61501 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2f1Q61501 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2f1Q61501 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2f1Q61501 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f1Q61501 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2f1Q61501 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
E2f1Q61501 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
E2f1Q61501 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2f1Q61501 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2f1Q61501 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2f1Q61501 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
E2f1Q61501 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
E2f1Q61501 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2f1Q61501 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E2f1Q61501 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2f1Q61501 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2f1Q61501 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f1Q61501 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f1Q61501 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f1Q61501 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f1Q61501 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms