Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CcnhQ61458 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CcnhQ61458 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CcnhQ61458 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CcnhQ61458 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CcnhQ61458 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CcnhQ61458 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CcnhQ61458 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CcnhQ61458 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CcnhQ61458 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CcnhQ61458 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CcnhQ61458 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CcnhQ61458 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CcnhQ61458 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CcnhQ61458 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CcnhQ61458 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CcnhQ61458 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CcnhQ61458 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CcnhQ61458 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CcnhQ61458 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CcnhQ61458 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CcnhQ61458 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CcnhQ61458 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CcnhQ61458 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CcnhQ61458 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CcnhQ61458 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CcnhQ61458 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CcnhQ61458 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CcnhQ61458 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CcnhQ61458 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CcnhQ61458 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CcnhQ61458 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CcnhQ61458 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CcnhQ61458 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CcnhQ61458 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CcnhQ61458 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CcnhQ61458 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CcnhQ61458 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms