Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hif1aQ61221 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hif1aQ61221 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hif1aQ61221 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hif1aQ61221 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hif1aQ61221 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hif1aQ61221 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hif1aQ61221 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hif1aQ61221 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hif1aQ61221 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hif1aQ61221 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hif1aQ61221 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hif1aQ61221 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hif1aQ61221 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hif1aQ61221 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hif1aQ61221 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hif1aQ61221 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hif1aQ61221 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hif1aQ61221 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hif1aQ61221 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hif1aQ61221 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hif1aQ61221 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hif1aQ61221 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hif1aQ61221 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hif1aQ61221 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hif1aQ61221 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hif1aQ61221 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hif1aQ61221 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hif1aQ61221 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hif1aQ61221 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hif1aQ61221 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hif1aQ61221 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hif1aQ61221 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hif1aQ61221 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hif1aQ61221 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hif1aQ61221 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hif1aQ61221 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hif1aQ61221 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hif1aQ61221 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hif1aQ61221 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hif1aQ61221 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hif1aQ61221 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hif1aQ61221 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hif1aQ61221 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hif1aQ61221 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hif1aQ61221 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms