Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf235Q61116 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf235Q61116 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf235Q61116 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Znf235Q61116 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Znf235Q61116 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf235Q61116 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znf235Q61116 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znf235Q61116 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znf235Q61116 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znf235Q61116 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Znf235Q61116 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf235Q61116 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf235Q61116 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Znf235Q61116 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf235Q61116 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Znf235Q61116 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Znf235Q61116 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf235Q61116 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf235Q61116 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Znf235Q61116 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Znf235Q61116 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf235Q61116 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Znf235Q61116 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf235Q61116 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf235Q61116 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf235Q61116 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf235Q61116 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf235Q61116 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf235Q61116 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf235Q61116 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf235Q61116 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf235Q61116 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf235Q61116 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf235Q61116 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf235Q61116 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf235Q61116 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf235Q61116 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf235Q61116 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf235Q61116 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf235Q61116 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf235Q61116 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf235Q61116 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf235Q61116 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf235Q61116 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf235Q61116 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf235Q61116 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf235Q61116 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf235Q61116 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf235Q61116 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf235Q61116 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf235Q61116 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf235Q61116 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf235Q61116 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms