Protein–RNA interactions for Protein: Q61088

Fzd4, Frizzled-4, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd4Q61088 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fzd4Q61088 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fzd4Q61088 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fzd4Q61088 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fzd4Q61088 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fzd4Q61088 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fzd4Q61088 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fzd4Q61088 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fzd4Q61088 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fzd4Q61088 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fzd4Q61088 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fzd4Q61088 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fzd4Q61088 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fzd4Q61088 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fzd4Q61088 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fzd4Q61088 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fzd4Q61088 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fzd4Q61088 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fzd4Q61088 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fzd4Q61088 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fzd4Q61088 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fzd4Q61088 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fzd4Q61088 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fzd4Q61088 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fzd4Q61088 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fzd4Q61088 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fzd4Q61088 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fzd4Q61088 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fzd4Q61088 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fzd4Q61088 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fzd4Q61088 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fzd4Q61088 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fzd4Q61088 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fzd4Q61088 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fzd4Q61088 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fzd4Q61088 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fzd4Q61088 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fzd4Q61088 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fzd4Q61088 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fzd4Q61088 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms