Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc1Q61056 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc1Q61056 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc1Q61056 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc1Q61056 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc1Q61056 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpc1Q61056 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms