Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2a1Q60737 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk2a1Q60737 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk2a1Q60737 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Csnk2a1Q60737 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk2a1Q60737 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms