Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Specc1Q5SXY1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Specc1Q5SXY1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Specc1Q5SXY1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Specc1Q5SXY1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Specc1Q5SXY1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Specc1Q5SXY1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Specc1Q5SXY1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Specc1Q5SXY1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Specc1Q5SXY1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Specc1Q5SXY1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Specc1Q5SXY1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Specc1Q5SXY1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Specc1Q5SXY1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Specc1Q5SXY1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Specc1Q5SXY1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Specc1Q5SXY1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Specc1Q5SXY1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Specc1Q5SXY1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Specc1Q5SXY1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Specc1Q5SXY1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Specc1Q5SXY1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Specc1Q5SXY1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Specc1Q5SXY1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Specc1Q5SXY1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Specc1Q5SXY1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Specc1Q5SXY1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Specc1Q5SXY1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Specc1Q5SXY1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Specc1Q5SXY1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Specc1Q5SXY1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Specc1Q5SXY1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Specc1Q5SXY1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Specc1Q5SXY1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Specc1Q5SXY1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Specc1Q5SXY1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Specc1Q5SXY1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Specc1Q5SXY1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Specc1Q5SXY1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Specc1Q5SXY1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Specc1Q5SXY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Specc1Q5SXY1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Specc1Q5SXY1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Specc1Q5SXY1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Specc1Q5SXY1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Specc1Q5SXY1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Specc1Q5SXY1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Specc1Q5SXY1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Specc1Q5SXY1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Specc1Q5SXY1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Specc1Q5SXY1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms