Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trdv2-2Q5R1A4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms