Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC44,17■■■■■ 4,66
Trim41Q5NCC3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,16■■■■■ 4,66
Trim41Q5NCC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44,14■■■■■ 4,66
Trim41Q5NCC3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC44,13■■■■■ 4,66
Trim41Q5NCC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,13■■■■■ 4,66
Trim41Q5NCC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44,11■■■■■ 4,65
Trim41Q5NCC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC44,09■■■■■ 4,65
Trim41Q5NCC3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC44,08■■■■■ 4,65
Trim41Q5NCC3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,08■■■■■ 4,65
Trim41Q5NCC3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC44,07■■■■■ 4,65
Trim41Q5NCC3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC44,06■■■■■ 4,64
Trim41Q5NCC3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC44,06■■■■■ 4,64
Trim41Q5NCC3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC44,06■■■■■ 4,64
Trim41Q5NCC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44,05■■■■■ 4,64
Trim41Q5NCC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,05■■■■■ 4,64
Trim41Q5NCC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC44,03■■■■■ 4,64
Trim41Q5NCC3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC44,01■■■■■ 4,64
Trim41Q5NCC3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,01■■■■■ 4,64
Trim41Q5NCC3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC44,01■■■■■ 4,64
Trim41Q5NCC3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,01■■■■■ 4,64
Trim41Q5NCC3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC44■■■■■ 4,63
Trim41Q5NCC3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC43,99■■■■■ 4,63
Trim41Q5NCC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC43,99■■■■■ 4,63
Trim41Q5NCC3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC43,99■■■■■ 4,63
Trim41Q5NCC3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,97■■■■■ 4,63
Trim41Q5NCC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC43,95■■■■■ 4,63
Trim41Q5NCC3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43,94■■■■■ 4,63
Trim41Q5NCC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43,92■■■■■ 4,62
Trim41Q5NCC3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,92■■■■■ 4,62
Trim41Q5NCC3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,92■■■■■ 4,62
Trim41Q5NCC3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC43,91■■■■■ 4,62
Trim41Q5NCC3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC43,89■■■■■ 4,62
Trim41Q5NCC3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,89■■■■■ 4,62
Trim41Q5NCC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,88■■■■■ 4,62
Trim41Q5NCC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC43,84■■■■■ 4,61
Trim41Q5NCC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC43,84■■■■■ 4,61
Trim41Q5NCC3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC43,83■■■■■ 4,61
Trim41Q5NCC3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43,83■■■■■ 4,61
Trim41Q5NCC3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
Trim41Q5NCC3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
Trim41Q5NCC3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
Trim41Q5NCC3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
Trim41Q5NCC3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
Trim41Q5NCC3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC43,8■■■■■ 4,6
Trim41Q5NCC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,79■■■■■ 4,6
Trim41Q5NCC3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,78■■■■■ 4,6
Trim41Q5NCC3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC43,78■■■■■ 4,6
Trim41Q5NCC3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Trim41Q5NCC3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Trim41Q5NCC3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC43,72■■■■■ 4,59
Trim41Q5NCC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC43,71■■■■■ 4,59
Trim41Q5NCC3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
Trim41Q5NCC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,68■■■■■ 4,58
Trim41Q5NCC3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC43,68■■■■■ 4,58
Trim41Q5NCC3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC43,67■■■■■ 4,58
Trim41Q5NCC3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,67■■■■■ 4,58
Trim41Q5NCC3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,67■■■■■ 4,58
Trim41Q5NCC3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC43,66■■■■■ 4,58
Trim41Q5NCC3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC43,63■■■■■ 4,58
Trim41Q5NCC3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,63■■■■■ 4,57
Trim41Q5NCC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,62■■■■■ 4,57
Trim41Q5NCC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43,62■■■■■ 4,57
Trim41Q5NCC3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC43,62■■■■■ 4,57
Trim41Q5NCC3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,6■■■■■ 4,57
Trim41Q5NCC3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,6■■■■■ 4,57
Trim41Q5NCC3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC43,58■■■■■ 4,57
Trim41Q5NCC3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43,58■■■■■ 4,57
Trim41Q5NCC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,56■■■■■ 4,56
Trim41Q5NCC3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,56■■■■■ 4,56
Trim41Q5NCC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC43,55■■■■■ 4,56
Trim41Q5NCC3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,55■■■■■ 4,56
Trim41Q5NCC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,53■■■■■ 4,56
Trim41Q5NCC3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,52■■■■■ 4,56
Trim41Q5NCC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC43,51■■■■■ 4,56
Trim41Q5NCC3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,5■■■■■ 4,55
Trim41Q5NCC3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,49■■■■■ 4,55
Trim41Q5NCC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,47■■■■■ 4,55
Trim41Q5NCC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC43,47■■■■■ 4,55
Trim41Q5NCC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,46■■■■■ 4,55
Trim41Q5NCC3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC43,45■■■■■ 4,55
Trim41Q5NCC3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC43,45■■■■■ 4,55
Trim41Q5NCC3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,45■■■■■ 4,55
Trim41Q5NCC3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC43,44■■■■■ 4,54
Trim41Q5NCC3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,42■■■■■ 4,54
Trim41Q5NCC3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,42■■■■■ 4,54
Trim41Q5NCC3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,4■■■■■ 4,54
Trim41Q5NCC3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,39■■■■■ 4,54
Trim41Q5NCC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
Trim41Q5NCC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,35■■■■■ 4,53
Trim41Q5NCC3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC43,35■■■■■ 4,53
Trim41Q5NCC3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,34■■■■■ 4,53
Trim41Q5NCC3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC43,33■■■■■ 4,53
Trim41Q5NCC3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,3■■■■■ 4,52
Trim41Q5NCC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,3■■■■■ 4,52
Trim41Q5NCC3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,29■■■■■ 4,52
Trim41Q5NCC3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,29■■■■■ 4,52
Trim41Q5NCC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC43,28■■■■■ 4,52
Trim41Q5NCC3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43,28■■■■■ 4,52
Trim41Q5NCC3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,28■■■■■ 4,52
Trim41Q5NCC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43,26■■■■■ 4,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,1 ms