Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttf2Q5NC05 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttf2Q5NC05 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttf2Q5NC05 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttf2Q5NC05 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttf2Q5NC05 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttf2Q5NC05 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttf2Q5NC05 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttf2Q5NC05 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttf2Q5NC05 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ttf2Q5NC05 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttf2Q5NC05 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttf2Q5NC05 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttf2Q5NC05 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttf2Q5NC05 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttf2Q5NC05 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttf2Q5NC05 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttf2Q5NC05 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttf2Q5NC05 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttf2Q5NC05 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttf2Q5NC05 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttf2Q5NC05 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttf2Q5NC05 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttf2Q5NC05 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttf2Q5NC05 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttf2Q5NC05 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttf2Q5NC05 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttf2Q5NC05 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttf2Q5NC05 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttf2Q5NC05 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttf2Q5NC05 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttf2Q5NC05 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttf2Q5NC05 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttf2Q5NC05 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms