Protein–RNA interactions for Protein: Q5IRJ6

Slc30a9, Zinc transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a9Q5IRJ6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc30a9Q5IRJ6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc30a9Q5IRJ6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc30a9Q5IRJ6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc30a9Q5IRJ6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc30a9Q5IRJ6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc30a9Q5IRJ6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc30a9Q5IRJ6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc30a9Q5IRJ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc30a9Q5IRJ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc30a9Q5IRJ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc30a9Q5IRJ6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc30a9Q5IRJ6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc30a9Q5IRJ6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc30a9Q5IRJ6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc30a9Q5IRJ6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc30a9Q5IRJ6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc30a9Q5IRJ6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc30a9Q5IRJ6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc30a9Q5IRJ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc30a9Q5IRJ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc30a9Q5IRJ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc30a9Q5IRJ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc30a9Q5IRJ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc30a9Q5IRJ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc30a9Q5IRJ6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc30a9Q5IRJ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc30a9Q5IRJ6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc30a9Q5IRJ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc30a9Q5IRJ6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc30a9Q5IRJ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc30a9Q5IRJ6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc30a9Q5IRJ6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc30a9Q5IRJ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc30a9Q5IRJ6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc30a9Q5IRJ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc30a9Q5IRJ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc30a9Q5IRJ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc30a9Q5IRJ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc30a9Q5IRJ6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc30a9Q5IRJ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc30a9Q5IRJ6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc30a9Q5IRJ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc30a9Q5IRJ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms