Protein–RNA interactions for Protein: Q504P9

Rhox4e, Reproductive homeobox 4E, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4eQ504P9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rhox4eQ504P9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rhox4eQ504P9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rhox4eQ504P9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rhox4eQ504P9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rhox4eQ504P9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox4eQ504P9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox4eQ504P9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox4eQ504P9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhox4eQ504P9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox4eQ504P9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms