Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx25Q3ZT31 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx25Q3ZT31 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx25Q3ZT31 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx25Q3ZT31 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx25Q3ZT31 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx25Q3ZT31 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx25Q3ZT31 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx25Q3ZT31 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx25Q3ZT31 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx25Q3ZT31 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx25Q3ZT31 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx25Q3ZT31 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx25Q3ZT31 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx25Q3ZT31 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx25Q3ZT31 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx25Q3ZT31 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snx25Q3ZT31 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx25Q3ZT31 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx25Q3ZT31 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx25Q3ZT31 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx25Q3ZT31 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx25Q3ZT31 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx25Q3ZT31 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx25Q3ZT31 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx25Q3ZT31 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx25Q3ZT31 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx25Q3ZT31 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx25Q3ZT31 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx25Q3ZT31 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx25Q3ZT31 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx25Q3ZT31 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx25Q3ZT31 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx25Q3ZT31 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx25Q3ZT31 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms