Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil2Q3V3V9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil2Q3V3V9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil2Q3V3V9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil2Q3V3V9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Carmil2Q3V3V9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Carmil2Q3V3V9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Carmil2Q3V3V9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil2Q3V3V9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil2Q3V3V9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Carmil2Q3V3V9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Carmil2Q3V3V9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil2Q3V3V9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil2Q3V3V9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Carmil2Q3V3V9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Carmil2Q3V3V9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil2Q3V3V9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Carmil2Q3V3V9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Carmil2Q3V3V9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Carmil2Q3V3V9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Carmil2Q3V3V9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Carmil2Q3V3V9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil2Q3V3V9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Carmil2Q3V3V9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Carmil2Q3V3V9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Carmil2Q3V3V9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Carmil2Q3V3V9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil2Q3V3V9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Carmil2Q3V3V9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Carmil2Q3V3V9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Carmil2Q3V3V9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Carmil2Q3V3V9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil2Q3V3V9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carmil2Q3V3V9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Carmil2Q3V3V9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Carmil2Q3V3V9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Carmil2Q3V3V9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Carmil2Q3V3V9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil2Q3V3V9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil2Q3V3V9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil2Q3V3V9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Carmil2Q3V3V9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carmil2Q3V3V9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Carmil2Q3V3V9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Carmil2Q3V3V9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Carmil2Q3V3V9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Carmil2Q3V3V9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Carmil2Q3V3V9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Carmil2Q3V3V9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Carmil2Q3V3V9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Carmil2Q3V3V9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms