Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1N9

A3galt2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3galt2Q3V1N9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A3galt2Q3V1N9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A3galt2Q3V1N9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A3galt2Q3V1N9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3galt2Q3V1N9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3galt2Q3V1N9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3galt2Q3V1N9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3galt2Q3V1N9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
A3galt2Q3V1N9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3galt2Q3V1N9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A3galt2Q3V1N9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A3galt2Q3V1N9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3galt2Q3V1N9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3galt2Q3V1N9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
A3galt2Q3V1N9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3galt2Q3V1N9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A3galt2Q3V1N9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms