Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc110Q3V125 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc110Q3V125 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc110Q3V125 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc110Q3V125 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc110Q3V125 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc110Q3V125 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc110Q3V125 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc110Q3V125 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc110Q3V125 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc110Q3V125 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc110Q3V125 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc110Q3V125 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc110Q3V125 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc110Q3V125 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc110Q3V125 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc110Q3V125 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc110Q3V125 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc110Q3V125 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc110Q3V125 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc110Q3V125 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc110Q3V125 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc110Q3V125 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc110Q3V125 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc110Q3V125 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms