Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY23

Fdxacb1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdxacb1Q3UY23 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fdxacb1Q3UY23 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fdxacb1Q3UY23 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fdxacb1Q3UY23 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fdxacb1Q3UY23 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fdxacb1Q3UY23 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fdxacb1Q3UY23 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fdxacb1Q3UY23 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fdxacb1Q3UY23 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fdxacb1Q3UY23 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fdxacb1Q3UY23 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fdxacb1Q3UY23 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fdxacb1Q3UY23 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fdxacb1Q3UY23 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fdxacb1Q3UY23 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fdxacb1Q3UY23 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fdxacb1Q3UY23 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fdxacb1Q3UY23 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fdxacb1Q3UY23 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fdxacb1Q3UY23 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fdxacb1Q3UY23 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fdxacb1Q3UY23 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Fdxacb1Q3UY23 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fdxacb1Q3UY23 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fdxacb1Q3UY23 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fdxacb1Q3UY23 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fdxacb1Q3UY23 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fdxacb1Q3UY23 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fdxacb1Q3UY23 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fdxacb1Q3UY23 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fdxacb1Q3UY23 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fdxacb1Q3UY23 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fdxacb1Q3UY23 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fdxacb1Q3UY23 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fdxacb1Q3UY23 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fdxacb1Q3UY23 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Fdxacb1Q3UY23 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fdxacb1Q3UY23 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Fdxacb1Q3UY23 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fdxacb1Q3UY23 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Fdxacb1Q3UY23 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fdxacb1Q3UY23 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms