Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr1d1Q3UV55 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr1d1Q3UV55 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nr1d1Q3UV55 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr1d1Q3UV55 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr1d1Q3UV55 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nr1d1Q3UV55 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr1d1Q3UV55 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr1d1Q3UV55 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nr1d1Q3UV55 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nr1d1Q3UV55 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nr1d1Q3UV55 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr1d1Q3UV55 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr1d1Q3UV55 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nr1d1Q3UV55 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nr1d1Q3UV55 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr1d1Q3UV55 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nr1d1Q3UV55 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nr1d1Q3UV55 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms