Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms