Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc34Q3UI66 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc34Q3UI66 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc34Q3UI66 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc34Q3UI66 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc34Q3UI66 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc34Q3UI66 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc34Q3UI66 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc34Q3UI66 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc34Q3UI66 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc34Q3UI66 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc34Q3UI66 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc34Q3UI66 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc34Q3UI66 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc34Q3UI66 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc34Q3UI66 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc34Q3UI66 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc34Q3UI66 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc34Q3UI66 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc34Q3UI66 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc34Q3UI66 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc34Q3UI66 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc34Q3UI66 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc34Q3UI66 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc34Q3UI66 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms