Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nom1Q3UFM5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nom1Q3UFM5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nom1Q3UFM5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nom1Q3UFM5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nom1Q3UFM5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nom1Q3UFM5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nom1Q3UFM5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nom1Q3UFM5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nom1Q3UFM5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nom1Q3UFM5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nom1Q3UFM5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nom1Q3UFM5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Nom1Q3UFM5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nom1Q3UFM5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nom1Q3UFM5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Nom1Q3UFM5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nom1Q3UFM5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nom1Q3UFM5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nom1Q3UFM5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nom1Q3UFM5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nom1Q3UFM5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nom1Q3UFM5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nom1Q3UFM5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nom1Q3UFM5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nom1Q3UFM5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nom1Q3UFM5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nom1Q3UFM5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nom1Q3UFM5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nom1Q3UFM5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nom1Q3UFM5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nom1Q3UFM5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nom1Q3UFM5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nom1Q3UFM5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nom1Q3UFM5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Nom1Q3UFM5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nom1Q3UFM5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nom1Q3UFM5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nom1Q3UFM5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nom1Q3UFM5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nom1Q3UFM5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nom1Q3UFM5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nom1Q3UFM5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nom1Q3UFM5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.7 ms