Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft2Q3UF64 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnft2Q3UF64 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnft2Q3UF64 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnft2Q3UF64 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnft2Q3UF64 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft2Q3UF64 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft2Q3UF64 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft2Q3UF64 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft2Q3UF64 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft2Q3UF64 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft2Q3UF64 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnft2Q3UF64 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnft2Q3UF64 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnft2Q3UF64 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnft2Q3UF64 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms