Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Parp8Q3UD82 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Parp8Q3UD82 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Parp8Q3UD82 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22,26■■□□□ 1,15
Parp8Q3UD82 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22,25■■□□□ 1,15
Parp8Q3UD82 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Parp8Q3UD82 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Parp8Q3UD82 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Parp8Q3UD82 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Parp8Q3UD82 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Parp8Q3UD82 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Parp8Q3UD82 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,14
Parp8Q3UD82 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Parp8Q3UD82 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Parp8Q3UD82 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Parp8Q3UD82 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Parp8Q3UD82 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Parp8Q3UD82 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Parp8Q3UD82 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Parp8Q3UD82 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Parp8Q3UD82 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Parp8Q3UD82 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Parp8Q3UD82 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Parp8Q3UD82 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Parp8Q3UD82 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Parp8Q3UD82 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Parp8Q3UD82 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Parp8Q3UD82 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Parp8Q3UD82 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Parp8Q3UD82 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Parp8Q3UD82 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Parp8Q3UD82 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Parp8Q3UD82 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Parp8Q3UD82 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Parp8Q3UD82 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,2 ms