Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn7l3bQ3UD01 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn7l3bQ3UD01 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn7l3bQ3UD01 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atxn7l3bQ3UD01 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn7l3bQ3UD01 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms