Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pid1Q3UBG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pid1Q3UBG2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pid1Q3UBG2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pid1Q3UBG2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pid1Q3UBG2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pid1Q3UBG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pid1Q3UBG2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pid1Q3UBG2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pid1Q3UBG2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pid1Q3UBG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pid1Q3UBG2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pid1Q3UBG2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pid1Q3UBG2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pid1Q3UBG2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pid1Q3UBG2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pid1Q3UBG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pid1Q3UBG2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pid1Q3UBG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pid1Q3UBG2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pid1Q3UBG2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pid1Q3UBG2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pid1Q3UBG2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pid1Q3UBG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pid1Q3UBG2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pid1Q3UBG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pid1Q3UBG2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pid1Q3UBG2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pid1Q3UBG2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pid1Q3UBG2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pid1Q3UBG2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pid1Q3UBG2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pid1Q3UBG2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pid1Q3UBG2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms