Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3U7U4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3U7U4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3U7U4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3U7U4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3U7U4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3U7U4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3U7U4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3U7U4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3U7U4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3U7U4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3U7U4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3U7U4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q3U7U4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3U7U4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3U7U4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3U7U4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3U7U4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3U7U4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3U7U4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3U7U4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3U7U4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3U7U4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3U7U4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3U7U4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3U7U4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3U7U4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3U7U4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3U7U4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms