Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl21Q3U410 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl21Q3U410 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl21Q3U410 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl21Q3U410 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl21Q3U410 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl21Q3U410 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl21Q3U410 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms