Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Rnf149Q3U2C5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Rnf149Q3U2C5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Rnf149Q3U2C5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Rnf149Q3U2C5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Rnf149Q3U2C5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Rnf149Q3U2C5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Rnf149Q3U2C5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Rnf149Q3U2C5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Rnf149Q3U2C5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Rnf149Q3U2C5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Rnf149Q3U2C5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Rnf149Q3U2C5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21,8■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Rnf149Q3U2C5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21,75■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Rnf149Q3U2C5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Rnf149Q3U2C5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Rnf149Q3U2C5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,68■■□□□ 1,06
Rnf149Q3U2C5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Rnf149Q3U2C5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Rnf149Q3U2C5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rnf149Q3U2C5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rnf149Q3U2C5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Rnf149Q3U2C5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms