Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Zfyve27Q3TXX3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Zfyve27Q3TXX3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Zfyve27Q3TXX3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Zfyve27Q3TXX3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Zfyve27Q3TXX3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Zfyve27Q3TXX3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Zfyve27Q3TXX3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Zfyve27Q3TXX3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Zfyve27Q3TXX3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Zfyve27Q3TXX3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Zfyve27Q3TXX3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Zfyve27Q3TXX3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Zfyve27Q3TXX3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Zfyve27Q3TXX3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Zfyve27Q3TXX3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Zfyve27Q3TXX3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Zfyve27Q3TXX3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Zfyve27Q3TXX3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Zfyve27Q3TXX3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Zfyve27Q3TXX3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Zfyve27Q3TXX3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Zfyve27Q3TXX3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Zfyve27Q3TXX3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Zfyve27Q3TXX3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Zfyve27Q3TXX3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Zfyve27Q3TXX3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Zfyve27Q3TXX3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,3 ms