Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
V1rd19Q3KNP5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V1rd19Q3KNP5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
V1rd19Q3KNP5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
V1rd19Q3KNP5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
V1rd19Q3KNP5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V1rd19Q3KNP5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
V1rd19Q3KNP5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms