Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd300lgQ1ERP8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd300lgQ1ERP8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd300lgQ1ERP8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd300lgQ1ERP8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd300lgQ1ERP8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd300lgQ1ERP8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd300lgQ1ERP8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd300lgQ1ERP8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd300lgQ1ERP8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd300lgQ1ERP8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd300lgQ1ERP8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd300lgQ1ERP8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd300lgQ1ERP8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd300lgQ1ERP8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd300lgQ1ERP8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms