Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkpd1Q0VF94 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkpd1Q0VF94 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkpd1Q0VF94 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkpd1Q0VF94 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkpd1Q0VF94 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkpd1Q0VF94 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkpd1Q0VF94 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkpd1Q0VF94 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkpd1Q0VF94 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkpd1Q0VF94 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkpd1Q0VF94 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms