Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Atp2b3Q0VF55 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30,51■■■□□ 2,48
Atp2b3Q0VF55 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Atp2b3Q0VF55 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Atp2b3Q0VF55 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Atp2b3Q0VF55 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Atp2b3Q0VF55 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Atp2b3Q0VF55 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Atp2b3Q0VF55 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Atp2b3Q0VF55 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Atp2b3Q0VF55 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Atp2b3Q0VF55 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Atp2b3Q0VF55 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Atp2b3Q0VF55 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Atp2b3Q0VF55 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Atp2b3Q0VF55 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Atp2b3Q0VF55 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
Atp2b3Q0VF55 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Atp2b3Q0VF55 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Atp2b3Q0VF55 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Atp2b3Q0VF55 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Atp2b3Q0VF55 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Atp2b3Q0VF55 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Atp2b3Q0VF55 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Atp2b3Q0VF55 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Atp2b3Q0VF55 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Atp2b3Q0VF55 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Atp2b3Q0VF55 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Atp2b3Q0VF55 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Atp2b3Q0VF55 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Atp2b3Q0VF55 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Atp2b3Q0VF55 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Atp2b3Q0VF55 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Atp2b3Q0VF55 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Atp2b3Q0VF55 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
Atp2b3Q0VF55 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Atp2b3Q0VF55 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,8 ms