Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cntnap5cQ0V8T7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cntnap5cQ0V8T7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cntnap5cQ0V8T7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cntnap5cQ0V8T7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cntnap5cQ0V8T7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cntnap5cQ0V8T7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cntnap5cQ0V8T7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cntnap5cQ0V8T7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cntnap5cQ0V8T7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cntnap5cQ0V8T7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cntnap5cQ0V8T7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cntnap5cQ0V8T7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cntnap5cQ0V8T7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cntnap5cQ0V8T7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cntnap5cQ0V8T7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cntnap5cQ0V8T7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cntnap5cQ0V8T7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cntnap5cQ0V8T7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cntnap5cQ0V8T7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cntnap5cQ0V8T7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cntnap5cQ0V8T7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cntnap5cQ0V8T7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cntnap5cQ0V8T7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cntnap5cQ0V8T7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cntnap5cQ0V8T7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cntnap5cQ0V8T7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cntnap5cQ0V8T7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cntnap5cQ0V8T7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cntnap5cQ0V8T7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cntnap5cQ0V8T7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cntnap5cQ0V8T7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cntnap5cQ0V8T7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cntnap5cQ0V8T7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cntnap5cQ0V8T7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntnap5cQ0V8T7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms