Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn1r181Q0P547 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r181Q0P547 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r181Q0P547 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r181Q0P547 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r181Q0P547 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r181Q0P547 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r181Q0P547 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r181Q0P547 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r181Q0P547 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r181Q0P547 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r181Q0P547 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r181Q0P547 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r181Q0P547 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r181Q0P547 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r181Q0P547 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r181Q0P547 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms