Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd8Q09XV5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd8Q09XV5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd8Q09XV5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd8Q09XV5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd8Q09XV5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd8Q09XV5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd8Q09XV5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd8Q09XV5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd8Q09XV5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd8Q09XV5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd8Q09XV5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd8Q09XV5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd8Q09XV5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd8Q09XV5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd8Q09XV5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd8Q09XV5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd8Q09XV5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd8Q09XV5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd8Q09XV5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd8Q09XV5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd8Q09XV5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd8Q09XV5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd8Q09XV5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd8Q09XV5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd8Q09XV5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd8Q09XV5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd8Q09XV5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd8Q09XV5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd8Q09XV5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd8Q09XV5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd8Q09XV5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd8Q09XV5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd8Q09XV5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd8Q09XV5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd8Q09XV5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms