Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
Col17a1Q07563 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Col17a1Q07563 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Col17a1Q07563 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC40,96■■■■■ 4,15
Col17a1Q07563 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Col17a1Q07563 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40,93■■■■■ 4,14
Col17a1Q07563 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC40,91■■■■■ 4,14
Col17a1Q07563 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40,9■■■■■ 4,14
Col17a1Q07563 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Col17a1Q07563 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Col17a1Q07563 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Col17a1Q07563 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Col17a1Q07563 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Col17a1Q07563 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Col17a1Q07563 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Col17a1Q07563 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Col17a1Q07563 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Col17a1Q07563 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Col17a1Q07563 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Col17a1Q07563 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40,8■■■■■ 4,12
Col17a1Q07563 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC40,8■■■■■ 4,12
Col17a1Q07563 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Col17a1Q07563 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Col17a1Q07563 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Col17a1Q07563 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,72■■■■■ 4,11
Col17a1Q07563 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC40,71■■■■■ 4,11
Col17a1Q07563 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC40,71■■■■■ 4,11
Col17a1Q07563 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC40,7■■■■■ 4,11
Col17a1Q07563 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Col17a1Q07563 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Col17a1Q07563 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Col17a1Q07563 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Col17a1Q07563 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Col17a1Q07563 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Col17a1Q07563 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Col17a1Q07563 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Col17a1Q07563 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Col17a1Q07563 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC40,61■■■■■ 4,09
Col17a1Q07563 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Col17a1Q07563 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,08
Col17a1Q07563 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC40,56■■■■■ 4,08
Col17a1Q07563 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Col17a1Q07563 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Col17a1Q07563 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Col17a1Q07563 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Col17a1Q07563 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40,54■■■■■ 4,08
Col17a1Q07563 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Col17a1Q07563 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC40,47■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40,46■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Col17a1Q07563 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,42■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC40,4■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC40,39■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Col17a1Q07563 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC40,38■■■■■ 4,05
Col17a1Q07563 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Col17a1Q07563 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Col17a1Q07563 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Col17a1Q07563 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Col17a1Q07563 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Col17a1Q07563 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC40,32■■■■■ 4,05
Col17a1Q07563 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40,31■■■■■ 4,04
Col17a1Q07563 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Col17a1Q07563 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Col17a1Q07563 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
Col17a1Q07563 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,26■■■■■ 4,04
Col17a1Q07563 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC40,26■■■■■ 4,04
Col17a1Q07563 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Col17a1Q07563 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40,26■■■■■ 4,03
Col17a1Q07563 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,03
Col17a1Q07563 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC40,26■■■■■ 4,03
Col17a1Q07563 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Col17a1Q07563 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40,24■■■■■ 4,03
Col17a1Q07563 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC40,2■■■■■ 4,03
Col17a1Q07563 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40,2■■■■■ 4,03
Col17a1Q07563 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Col17a1Q07563 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Col17a1Q07563 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC40,18■■■■■ 4,02
Col17a1Q07563 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC40,17■■■■■ 4,02
Col17a1Q07563 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Col17a1Q07563 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40,14■■■■■ 4,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms