Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk18Q04899 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk18Q04899 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk18Q04899 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk18Q04899 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk18Q04899 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk18Q04899 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk18Q04899 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk18Q04899 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk18Q04899 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk18Q04899 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk18Q04899 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk18Q04899 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk18Q04899 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk18Q04899 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk18Q04899 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk18Q04899 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk18Q04899 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk18Q04899 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk18Q04899 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk18Q04899 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk18Q04899 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk18Q04899 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk18Q04899 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk18Q04899 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk18Q04899 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk18Q04899 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk18Q04899 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk18Q04899 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk18Q04899 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk18Q04899 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk18Q04899 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk18Q04899 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk18Q04899 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk18Q04899 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk18Q04899 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk18Q04899 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk18Q04899 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk18Q04899 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms