Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Crisp3Q03402 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Crisp3Q03402 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Crisp3Q03402 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp3Q03402 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Crisp3Q03402 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp3Q03402 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms