Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msx2Q03358 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msx2Q03358 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msx2Q03358 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msx2Q03358 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msx2Q03358 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msx2Q03358 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msx2Q03358 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Msx2Q03358 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msx2Q03358 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msx2Q03358 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msx2Q03358 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msx2Q03358 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msx2Q03358 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msx2Q03358 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msx2Q03358 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Msx2Q03358 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msx2Q03358 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msx2Q03358 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msx2Q03358 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msx2Q03358 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms