Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Runx1Q03347 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Runx1Q03347 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Runx1Q03347 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Runx1Q03347 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Runx1Q03347 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Runx1Q03347 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Runx1Q03347 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Runx1Q03347 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Runx1Q03347 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Runx1Q03347 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Runx1Q03347 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Runx1Q03347 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Runx1Q03347 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Runx1Q03347 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms