Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp39Q02525 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp39Q02525 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp39Q02525 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp39Q02525 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp39Q02525 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp39Q02525 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp39Q02525 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp39Q02525 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp39Q02525 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp39Q02525 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zfp39Q02525 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp39Q02525 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp39Q02525 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp39Q02525 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp39Q02525 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp39Q02525 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp39Q02525 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp39Q02525 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp39Q02525 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp39Q02525 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp39Q02525 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp39Q02525 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp39Q02525 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp39Q02525 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp39Q02525 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp39Q02525 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms