Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna1cQ01815 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1cQ01815 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1cQ01815 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1cQ01815 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1cQ01815 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1cQ01815 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1cQ01815 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1cQ01815 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1cQ01815 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1cQ01815 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1cQ01815 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1cQ01815 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1cQ01815 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1cQ01815 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1cQ01815 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1cQ01815 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms