Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsu1Q01730 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsu1Q01730 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsu1Q01730 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsu1Q01730 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsu1Q01730 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsu1Q01730 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsu1Q01730 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsu1Q01730 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsu1Q01730 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsu1Q01730 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsu1Q01730 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsu1Q01730 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsu1Q01730 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsu1Q01730 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsu1Q01730 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsu1Q01730 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsu1Q01730 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsu1Q01730 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsu1Q01730 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsu1Q01730 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsu1Q01730 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsu1Q01730 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsu1Q01730 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms